ولد القديس بقرية شنشيف والتي تعرف حالياً باسم: "عرب بني واصل" مركز ساقلته، محافظة سوهاج، من أبوين مسيحيين محبين لله، ربياه وأدباه بآداب الكنيسة.
المراجع الموجودة حتى الآن لم توضح السنة التي ولد فيها الأنبا توماس، إلا أنه من الواضح أنه عاش حياة تزيد عن مائة سنة ولا تتعدى مائة وثلاثين سنة.
اشتاق القديس إلى السيرة الرهبانية، فخرج وسكن في جبل شنشيف القريب من قريته، وفي أحضان الجبل اختار مغارة عاش فيها حياة العزلة والنسك، متعبداً لله، مجاهداً بقوة وقلب مملوء بالقداسة، مداوماً على الصلاة ليلاً ونهاراً، وكان طعامه مرة واحدة في الأسبوع.
تأثر الأنبا توماس بالقديس العظيم الأنبا أنطونيوس مؤسس الرهبنة، فأحب حياة العزلة الفردية، ولم يكن يخالط الإخوة (الرهبان) إلا وقت الصلاة.
ومع ذلك لم يبخل الأنبا توماس بالمشورة لأحد من الإخوة بل كان يستمع إليه بنقاوة قلب وطول أناة.
كان يذهب إليه بين الحين والآخر بعض الآباء الرهبان والمتوحدين الذين يسكنون الجبل، طلباً للإرشاد الروحي وأخذ البركة.
وكان يذهب إليه بين الحين والآخر القديس الأنبا شنوده رئيس المتوحدين.
(قد يكون القديس الأنبا توماس بمثابة المرشد الروحي للأنبا شنوده أو العكس)
كان الأنبا شنوده يحث أبناءه دائما أن يذهبوا ويستفيدوا من بهاء جبل شنشيف ومن الأنبا توماس.
كان القديس ذا صوت هادئ في التسبيح لله -كصوت الملائكة، حافظاً الكتب المقدسة، كاملاً في الفضائل المسيحية.
أعطاه الله موهبة عمل الآيات والعجائب، مثل شفاء الأمراض وإخراج الشياطين.
كانت صلواته وأصوامه لها قوة وقدرة شديدة لإزعاج الشياطين وهروبهم، وكان لا يستطيع عدو الخير أن يقهره أو يهزمه.
شهد عنه الأنبا شنوده قائلاً: إنه لم يكن أحد يعادله وان السيد المخلص خاطبه فماً بفم وإن الملائكة حضروا عنده مراراً كثيرة.
أعطاه الله أيضاً موهبة النبوة، ومعرفة بعض أحداث المستقبل، إذ عرفه الروح القدس بيوم نياحته.
وفي أثناء زيارة القديس الأنبا شنوده إلى القديس الأنبا توماس -بجبل شنشيف، قال له الأنبا توماس إني سأفارقك، وقد أخبرني الرب أنك ستلحق بي بعد أيام.
فطلب الأنبا شنوده علامة من القديس.
فقال له: إن الحجر الموجود خارج مسكنك سينقسم إلى نصفين عند مفارقة نفسي من جسدي.
لما قرب وقت انتقال الأنبا توماس من هذا العالم الفاني، ظهر له رب المجد، وعزاه وقواه، ووعده بأن هذا المكان سيبنى فيه كنيسة على اسمه، ويأتون إليها من كل البلاد ويكون اسمه شائعاً. وأخبره بأنه بعد ثلاثة أيام سيترك الجسد وينال إكليل الحياة الدائم، ثم أعطاه السلام وصعد إلى السماء.
تنيح القديس بشيخوخة حسنه في اليوم السابع والعشرين من شهر بشنس سنة 168 للشهداء الموافق 452 م تقريباً.
عند انتقال القديس الأنبا توماس إلى السماء، كان الأنبا شنوده رئيس المتوحدين واقفاً خارج قلايته، فرأى الحجر الذي كان يجلس عليه قد انشق إلى نصفين، ففي الحال تنهد القديس وقال: لقد عدمت برية شنشيف سراجها المنير.
ولما قال هذا أبصر رئيس الملائكة رافائيل يشير إليه بيده اليمين ويقول: السلام لك يا خليل الله وحبيب سائر القديسين، هلم لنستر جسد القديس الأنبا توماس.
فقام القديس الأنبا شنوده وأخذ معه الأنبا ويصا تلميذه والأنبا يوساب الحكيم ومار أخنوخ والأنبا تمرينوس ليكفنوا الأنبا توماس.
كفنوا الجسد ودفنوه في المكان الذي كان ساكناً فيه.
وفي وقت تكفينه كان حاضراً السيد المسيح له المجد، وداود النبي.
ولقد تحققت نبوءة الأنبا توماس عن نياحة الأنبا شنوده رئيس المتوحدين، في اليوم السابع من أبيب.
بركة صلاتهم تكون معنا. أمين
